Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PDE7AQ13946 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms