Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXE3Q13461 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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FOXE3Q13461 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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FOXE3Q13461 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXE3Q13461 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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