Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRIM32Q13049 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRIM32Q13049 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms