Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
FOXD4Q12950 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
FOXD4Q12950 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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