Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXC1Q12948 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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