Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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