Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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USP18Q9UMW8 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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USP18Q9UMW8 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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USP18Q9UMW8 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
USP18Q9UMW8 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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