Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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RABGEF1Q9UJ41 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1Q9UJ41 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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