Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA11-203ENST00000622044 3633 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ADCY5-210ENST00000491190 3962 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF185-211ENST00000535861 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHB2-202ENST00000374630 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005324.4-204ENST00000413242 4262 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNB2-216ENST00000617363 4385 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RIPOR2-201ENST00000259698 5471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA10-202ENST00000612503 4462 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GNG8-201ENST00000300873 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001062.2-201ENST00000426029 127 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS29P3-201ENST00000439929 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000532.1-201ENST00000440999 177 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL430P-201ENST00000464176 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093162.2-201ENST00000501107 704 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HAL-203ENST00000541929 3846 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM37-214ENST00000625984 204 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM196A-202ENST00000522781 4403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF7-203ENST00000375723 4957 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms