Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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