Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CDO1Q16878 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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