Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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NKX1-1Q15270 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
NKX1-1Q15270 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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