Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PDE1CQ14123 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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