Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SEMA3BQ13214 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SEMA3BQ13214 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SEMA3BQ13214 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SEMA3BQ13214 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SEMA3BQ13214 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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