Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GRIK2Q13002 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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