Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRDP23468 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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PTPRDP23468 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRDP23468 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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