Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SOBPA7XYQ1 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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