Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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