Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CHCHD3Q9NX63 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD3Q9NX63 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms