Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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SAMD8Q96LT4 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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SAMD8Q96LT4 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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SAMD8Q96LT4 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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SAMD8Q96LT4 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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SAMD8Q96LT4 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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SAMD8Q96LT4 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SAMD8Q96LT4 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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