Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TPRNQ4KMQ1 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TPRNQ4KMQ1 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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