Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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