Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CNGA3Q16281 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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