Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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GRIK4Q16099 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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GRIK4Q16099 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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GRIK4Q16099 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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GRIK4Q16099 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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GRIK4Q16099 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK4Q16099 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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