Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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NEDD8Q15843 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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