Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
UBE3CQ15386 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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UBE3CQ15386 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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UBE3CQ15386 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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UBE3CQ15386 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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UBE3CQ15386 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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UBE3CQ15386 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
UBE3CQ15386 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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