Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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COL4A6Q14031 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL4A6Q14031 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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COL4A6Q14031 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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COL4A6Q14031 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL4A6Q14031 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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