Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCINQ13939 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCINQ13939 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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