Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GTF2H3Q13889 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms