Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CACNA1SQ13698 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1SQ13698 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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