Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTCH1Q13635 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTCH1Q13635 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTCH1Q13635 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTCH1Q13635 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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PTCH1Q13635 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTCH1Q13635 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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