Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDH18Q13634 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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