Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TCOF1Q13428 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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