Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PDE3BQ13370 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms