Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NR1H3Q13133 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms