Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RESTQ13127 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RESTQ13127 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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RESTQ13127 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
RESTQ13127 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RESTQ13127 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
RESTQ13127 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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RESTQ13127 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RESTQ13127 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RESTQ13127 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RESTQ13127 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
RESTQ13127 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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