Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRDNQ13061 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRDNQ13061 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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