Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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