Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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SNX13Q9Y5W8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SNX13Q9Y5W8 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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