Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SHOC2Q9UQ13 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SHOC2Q9UQ13 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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