Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TM7SF3Q9NS93 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
TM7SF3Q9NS93 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TM7SF3Q9NS93 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TM7SF3Q9NS93 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TM7SF3Q9NS93 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms