Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TMIEQ8NEW7 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms