Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALYREFQ86V81 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ALYREFQ86V81 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms