Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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ECM1Q16610 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ECM1Q16610 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ECM1Q16610 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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