Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
E2F4Q16254 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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