Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
LAPTM4AQ15012 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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