Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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