Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ERV3-1Q14264 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms