Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CBFBQ13951 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms