Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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GTF2H3Q13889 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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GTF2H3Q13889 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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GTF2H3Q13889 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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GTF2H3Q13889 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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GTF2H3Q13889 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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GTF2H3Q13889 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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GTF2H3Q13889 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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